Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace1P56818 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace1P56818 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Bace1P56818 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms