Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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