Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad23bP54728 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad23bP54728 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad23bP54728 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad23bP54728 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad23bP54728 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad23bP54728 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad23bP54728 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad23bP54728 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad23bP54728 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad23bP54728 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms