Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epb41l4aP52963 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Epb41l4aP52963 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Epb41l4aP52963 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Epb41l4aP52963 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Epb41l4aP52963 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Epb41l4aP52963 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Epb41l4aP52963 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epb41l4aP52963 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms