Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SftpbP50405 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SftpbP50405 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpbP50405 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpbP50405 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SftpbP50405 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SftpbP50405 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SftpbP50405 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SftpbP50405 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
SftpbP50405 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpbP50405 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpbP50405 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SftpbP50405 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpbP50405 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpbP50405 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpbP50405 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SftpbP50405 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpbP50405 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpbP50405 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SftpbP50405 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpbP50405 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpbP50405 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SftpbP50405 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpbP50405 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpbP50405 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpbP50405 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpbP50405 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SftpbP50405 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpbP50405 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SftpbP50405 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SftpbP50405 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
SftpbP50405 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SftpbP50405 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SftpbP50405 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SftpbP50405 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SftpbP50405 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms