Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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PtpreP49446 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PtpreP49446 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PtpreP49446 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PtpreP49446 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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