Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HpdP49429 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HpdP49429 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HpdP49429 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms