Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CitP49025 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CitP49025 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CitP49025 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CitP49025 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CitP49025 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CitP49025 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CitP49025 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CitP49025 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CitP49025 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CitP49025 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CitP49025 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CitP49025 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CitP49025 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CitP49025 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CitP49025 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CitP49025 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CitP49025 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CitP49025 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CitP49025 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CitP49025 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms