Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni3P48787 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms