Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms