Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

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Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rfx2P48379 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rfx2P48379 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rfx2P48379 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rfx2P48379 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rfx2P48379 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rfx2P48379 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rfx2P48379 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rfx2P48379 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rfx2P48379 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rfx2P48379 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rfx2P48379 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rfx2P48379 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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