Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfc1P35601 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms