Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp4P35123 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp4P35123 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Usp4P35123 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp4P35123 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Usp4P35123 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Usp4P35123 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp4P35123 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Usp4P35123 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Usp4P35123 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Usp4P35123 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp4P35123 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp4P35123 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp4P35123 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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