Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Saa4P31532 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Saa4P31532 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms