Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms