Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk4P30285 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk4P30285 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms