Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd3P30282 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms