Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprmP28828 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprmP28828 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprmP28828 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprmP28828 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprmP28828 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprmP28828 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprmP28828 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprmP28828 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprmP28828 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprmP28828 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
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