Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxraP28700 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxraP28700 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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