Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nckap1P28660 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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