Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col2a1P28481 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms