Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms