Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb7P26011 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms