Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms