Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P20040 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P20040 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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