Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18530 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
P18530 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
P18530 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
P18530 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
P18530 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
P18530 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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P18530 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18530 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18530 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18530 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18530 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18530 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18530 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18530 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18530 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18530 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
P18530 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18530 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
P18530 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18530 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18530 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18530 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18530 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18530 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18530 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18530 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18530 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18530 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms