Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lmnb1P14733 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmnb1P14733 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms