Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrm1P12657 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms