Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf1P09925 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf1P09925 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf1P09925 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms