Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TtrP07309 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TtrP07309 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TtrP07309 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TtrP07309 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TtrP07309 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TtrP07309 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TtrP07309 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TtrP07309 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TtrP07309 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TtrP07309 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TtrP07309 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TtrP07309 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TtrP07309 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TtrP07309 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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TtrP07309 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TtrP07309 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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TtrP07309 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TtrP07309 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TtrP07309 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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TtrP07309 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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TtrP07309 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TtrP07309 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TtrP07309 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TtrP07309 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TtrP07309 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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TtrP07309 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TtrP07309 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TtrP07309 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TtrP07309 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TtrP07309 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TtrP07309 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TtrP07309 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TtrP07309 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TtrP07309 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TtrP07309 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TtrP07309 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TtrP07309 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TtrP07309 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TtrP07309 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TtrP07309 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TtrP07309 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TtrP07309 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TtrP07309 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TtrP07309 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TtrP07309 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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