Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

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Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprcP06800 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PtprcP06800 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PtprcP06800 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprcP06800 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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PtprcP06800 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprcP06800 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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PtprcP06800 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PtprcP06800 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprcP06800 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PtprcP06800 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PtprcP06800 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprcP06800 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PtprcP06800 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PtprcP06800 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprcP06800 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprcP06800 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprcP06800 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprcP06800 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprcP06800 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PtprcP06800 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PtprcP06800 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprcP06800 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprcP06800 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprcP06800 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprcP06800 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms