Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04214 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P04214 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
P04214 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P04214 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P04214 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04214 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04214 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms