Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb1P04202 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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