Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01734 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01734 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01734 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01734 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01734 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01734 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01734 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01734 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01734 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01734 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01734 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01734 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01734 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01734 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01734 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01734 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01734 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01734 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01734 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01734 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01734 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01734 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01734 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01734 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01734 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01734 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01734 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01734 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01734 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01734 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01734 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01734 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01734 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01734 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01734 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01734 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01734 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01734 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01734 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01734 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01734 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01734 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01734 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01734 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01734 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01734 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01734 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01734 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01734 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01734 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01734 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01734 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01734 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01734 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01734 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01734 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01734 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01734 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01734 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01734 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01734 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01734 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01734 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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