Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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