Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ccl20O89093 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ccl20O89093 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ccl20O89093 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ccl20O89093 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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