Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShdO88834 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShdO88834 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShdO88834 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShdO88834 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShdO88834 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShdO88834 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShdO88834 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShdO88834 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShdO88834 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShdO88834 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShdO88834 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShdO88834 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShdO88834 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShdO88834 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShdO88834 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShdO88834 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShdO88834 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShdO88834 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShdO88834 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShdO88834 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ShdO88834 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ShdO88834 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ShdO88834 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ShdO88834 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShdO88834 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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