Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms