Protein–RNA interactions for Protein: O88451

Rdh7, Retinol dehydrogenase 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh7O88451 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh7O88451 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms