Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col5a1O88207 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms