Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp4O70480 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms