Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SfnO70456 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SfnO70456 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms