Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Syngr2O55101 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syngr2O55101 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms