Protein–RNA interactions for Protein: O55055

Trdmt1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdmt1O55055 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trdmt1O55055 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms