Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms