Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjd2O54851 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjd2O54851 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gjd2O54851 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjd2O54851 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms