Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaxO35602 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaxO35602 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaxO35602 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RaxO35602 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RaxO35602 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RaxO35602 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RaxO35602 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaxO35602 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaxO35602 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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