Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Opn1mwO35599 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Opn1mwO35599 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Opn1mwO35599 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Opn1mwO35599 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Opn1mwO35599 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms