Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rnf5O35445 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rnf5O35445 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rnf5O35445 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Rnf5O35445 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rnf5O35445 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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