Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xbp1O35426 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms